El Centro de Graduados e investigaciones en Química cuenta con cuatro líneas de investigación. Las líneas de investigación son el eje por medio del cual se ordenan las actividades que sustentan el quehacer científico del posgrado, se entiende como el conjunto de actividades realizadas por los grupos de investigadores y estudiantes, encaminadas a generación y/o aplicación del conocimiento. 

Las líneas de investigación son:

•    Síntesis de Productos Naturales y No naturales Biológicamente Activos

•    Química Orgánica en Fase Sólida

•    Síntesis, Caracterización y Modificación de Materiales Poliméricos

•    Detección y Remoción de Contaminantes del Medio Ambiente